111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3295 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  57.79 
 
 
249 aa  294  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  44.13 
 
 
247 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  43.62 
 
 
250 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  43.62 
 
 
250 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  43.22 
 
 
247 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  43.44 
 
 
243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  43.22 
 
 
248 aa  206  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  41.1 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  42.36 
 
 
248 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  43.23 
 
 
249 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  40.79 
 
 
244 aa  185  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  40.08 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  40.42 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  39.23 
 
 
320 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  39.76 
 
 
303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  38.61 
 
 
310 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  39.92 
 
 
306 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  37.21 
 
 
308 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  37.07 
 
 
275 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  34.6 
 
 
220 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  37.5 
 
 
275 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  34.02 
 
 
261 aa  144  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  36.6 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  30.4 
 
 
237 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  35.98 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  35.98 
 
 
270 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  33.19 
 
 
284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  35.65 
 
 
272 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  35.65 
 
 
272 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  35.68 
 
 
273 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  34.35 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  34.12 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  38.17 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
272 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  34.02 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  32.3 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  35.1 
 
 
259 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  36.75 
 
 
256 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  37.63 
 
 
257 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  33.48 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  33.75 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  31.8 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  32.65 
 
 
231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  34.93 
 
 
264 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  33.47 
 
 
263 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  33.84 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  31.8 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  35.83 
 
 
257 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  33.33 
 
 
260 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  29.22 
 
 
262 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  31.9 
 
 
278 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  32.45 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  34.05 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  29.65 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  29.15 
 
 
280 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  36.56 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  34.41 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  28.94 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  30.33 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  29.86 
 
 
230 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.96 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.68 
 
 
213 aa  62  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  26.36 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  25.65 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  24.89 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.21 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  27.51 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.26 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  28.16 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  25.73 
 
 
210 aa  52  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  23.68 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.12 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  23.25 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.45 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.25 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.25 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  23.25 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  23.25 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  23.25 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  24.35 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  23.25 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  23.25 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.83 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  24.26 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.42 
 
 
209 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  23.25 
 
 
210 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  25.9 
 
 
264 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  32.18 
 
 
238 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  26.05 
 
 
208 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  24.78 
 
 
212 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  21.21 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  24.27 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  27.02 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3221  cyclase family protein  27.34 
 
 
216 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  22.22 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  23.4 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  23.97 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  25.31 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>