139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3556 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  57.79 
 
 		 249 aa  294  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  45.87 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  46.19 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  44.21 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  44.21 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  42.92 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  43.83 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  45.37 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  40.59 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  44.02 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  41.63 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  41.2 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  43.16 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  36.6 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  38.96 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  38.53 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  35.66 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  33.9 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  36 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  37.98 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  38.26 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  36.05 
 
 		 310 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  37.5 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  37.77 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  36.75 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  35.32 
 
 		 303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  36.14 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  38.25 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  35.98 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  37.99 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  37.99 
 
 		 272 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  37 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  35.68 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  35.48 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  33.98 
 
 		 320 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  36.67 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  32.23 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  35.04 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  33.47 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  37.62 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  35.47 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  33.04 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  40 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  34.8 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  34.18 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  34.57 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  36.17 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  34.23 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  39.46 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  32.51 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  36.76 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  36.36 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  36.22 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  33.05 
 
 		 278 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  33.94 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  36.22 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  33.65 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  30.2 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30.39 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.89 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.32 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  27.36 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  29.61 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.19 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.85 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.85 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.85 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.44 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  28.75 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.42 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.66 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.42 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.42 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  25.2 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.42 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  23.87 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  27.95 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  27.97 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.91 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  33.77 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  25.11 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  27.88 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  26.41 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  27.73 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  28.04 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  28.31 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  26.41 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.81 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  26.2 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  26.41 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  27.54 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  26.2 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.31 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  24.89 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  27.39 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  25.93 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  25.83 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>