118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5013 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  100 
 
 		 256 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  63.2 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  38.53 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  43.56 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  40 
 
 		 319 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  37.09 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  37.26 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  37.26 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  35.68 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  37.09 
 
 		 249 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  35.66 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  37.09 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  36.54 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  35.83 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  33.33 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  34.56 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  33.93 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  34.56 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  36.75 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  34.72 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  34.09 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  34.18 
 
 		 249 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  37.25 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  36.99 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  37.56 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  37.56 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  34.86 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  36.59 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  35.32 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  30.8 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  29.54 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  29.54 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  37.07 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  36.89 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  33.94 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  33.64 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  34.85 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  41.62 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  34.63 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  33.05 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  34.33 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  29.66 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  29.05 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  30.54 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  33.94 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  36.68 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  33.5 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  34.67 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  34.54 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  31.12 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  29.48 
 
 		 306 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  37.37 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  24.55 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  27.94 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  22.64 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  29.32 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  26.69 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  26.07 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.86 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  27.84 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  42.73 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.03 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.35 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  30.39 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  29.32 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  32.35 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.3 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  26.89 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  27.94 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.12 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.12 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  23.94 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.77 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.12 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.12 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.12 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.91 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  28.42 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  28.71 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.82 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  24.02 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  24.6 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  26.73 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  35.09 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  24.6 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.55 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.76 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  24.9 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.06 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.15 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.49 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  32.35 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.81 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  29.09 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  29.47 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  27.27 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  28.07 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  36.92 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>