101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1523 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  61.57 
 
 
248 aa  314  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  59.17 
 
 
247 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  51.23 
 
 
243 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  46.86 
 
 
250 aa  227  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  46.86 
 
 
250 aa  227  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  42.32 
 
 
247 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  45.12 
 
 
248 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  43.9 
 
 
249 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  41.1 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  40.59 
 
 
249 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  43.62 
 
 
251 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  44.74 
 
 
244 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  41.83 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  39.91 
 
 
220 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  36.4 
 
 
303 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  34.5 
 
 
261 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  36.4 
 
 
306 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  35.06 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  34.12 
 
 
320 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  34.26 
 
 
310 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  31.42 
 
 
275 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  31.56 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  30.43 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  34.36 
 
 
272 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  34.36 
 
 
272 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  28.99 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  33.04 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  36.63 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  36.32 
 
 
270 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  33.07 
 
 
259 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  33.82 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  35.32 
 
 
270 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  31.09 
 
 
280 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  34.54 
 
 
257 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  35.94 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  32.16 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  32.78 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  28.93 
 
 
268 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  34.04 
 
 
264 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  35.03 
 
 
263 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  35.83 
 
 
260 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  33.33 
 
 
257 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  33.87 
 
 
257 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  35.38 
 
 
267 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  31.15 
 
 
258 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  31.36 
 
 
269 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  29.63 
 
 
259 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  36.36 
 
 
260 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  29.05 
 
 
256 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  27.85 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  30.85 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  28.33 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.1 
 
 
280 aa  85.1  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  25.22 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  31.91 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  24.18 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  28.15 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.02 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  29.15 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  24.03 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.72 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.72 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  23.79 
 
 
215 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.66 
 
 
216 aa  55.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  24.81 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.73 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  32.54 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24.67 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.24 
 
 
210 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.24 
 
 
210 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.24 
 
 
210 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.24 
 
 
210 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.91 
 
 
210 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.75 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  23.25 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  30.95 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  24.79 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  28.57 
 
 
291 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  22.37 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  26.11 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  23.01 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  23.62 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  26.42 
 
 
228 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  24.89 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  22.08 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  22.37 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  25.65 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.22 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  26 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  25.32 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  23.68 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  24 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  20.49 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  23.27 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.63 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>