218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3029 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  87.13 
 
 		 269 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  69.23 
 
 		 273 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  65.93 
 
 		 272 aa  357  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  44.89 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  49.55 
 
 		 275 aa  214  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  42.13 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  39.78 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  39.65 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  39.86 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  39.55 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  38.36 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  35.96 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  36.08 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  36.29 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  34.09 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  33.87 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  39.58 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  36.8 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  35.44 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  33.33 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  33.6 
 
 		 270 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  33.08 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  35.08 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  36.28 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  32.7 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  34.73 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  34.36 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  34.51 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  33.47 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  31.76 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  34.36 
 
 		 244 aa  122  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  34.56 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  36.68 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  32.84 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  31.75 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  34.78 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  35.55 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  35.22 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  32.28 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  30.97 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  37.44 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  31.42 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  29.65 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  29.65 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  29.82 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  29.86 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.4 
 
 		 213 aa  102  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  31.78 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  32.9 
 
 		 248 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  34.16 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  32.03 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  29.69 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  30 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  29.06 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  30.84 
 
 		 308 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  27.83 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  31 
 
 		 219 aa  89  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  27.39 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.17 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  29.85 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  31.12 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.78 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  28.57 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  25.39 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.35 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30.32 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.79 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  26.09 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  28 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.57 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  29.87 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  26.13 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  25.23 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.94 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  27.04 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  22.76 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  26.32 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.89 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  24.37 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  26.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  24.91 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  25.54 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  26.92 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  25.34 
 
 		 213 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  25.65 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  22.42 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  24.78 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  25.53 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  26.41 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  26.99 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  26.01 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  29.38 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  25.21 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.34 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  23.74 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  34.18 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>