188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1029 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  31.06 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  33.09 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  30.27 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  32.21 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.38 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  28.21 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  28.93 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  29.45 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  31.94 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  29.77 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  30.45 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  30.92 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  29.81 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  28.63 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  26.91 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  26.91 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  30.63 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  29.43 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  32.32 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.72 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  28.68 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  27.51 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  29.96 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.59 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  26.22 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25.78 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  29.93 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  31.77 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  27.56 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  27.56 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  31.19 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  27.8 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  26.02 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.02 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  26.32 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.48 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  24.14 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.84 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  25.19 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.84 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  30.09 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  27.78 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  27.78 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  29.2 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  26.49 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.52 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  24.81 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31.53 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  29.52 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  32.41 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.63 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  27.92 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.07 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  29.95 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  29.52 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.89 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  27.19 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.5 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  26.54 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  22.03 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  28.43 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  26.92 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  24.71 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.71 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.37 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.37 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  26.05 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.73 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.37 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.37 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.37 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  26.15 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.37 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  26.86 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  27.76 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.03 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  25.5 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.87 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  27.06 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  29.85 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.7 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  25.78 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  26.61 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.09 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  28.29 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  27.38 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  27 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  22.73 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  26.69 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  28.98 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  27.88 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  27.55 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  29.06 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  26.17 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  27.17 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  21.25 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  27.41 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  25.94 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>