95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4826 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  76.69 
 
 		 268 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  72.93 
 
 		 268 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  74.33 
 
 		 275 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  73.95 
 
 		 259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  73.46 
 
 		 267 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  71.76 
 
 		 262 aa  394  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  71.15 
 
 		 259 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  72.69 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  72.69 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  68.73 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  65.52 
 
 		 266 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  64.86 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  63.81 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  61.92 
 
 		 260 aa  344  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  62.02 
 
 		 260 aa  343  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  60.77 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  59 
 
 		 262 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  57.95 
 
 		 260 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  55.77 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  54.83 
 
 		 258 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  44.4 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  46.25 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.25 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  43.63 
 
 		 262 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  41.38 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  42.59 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  39.77 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  39.06 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  38.7 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  36.02 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  35.86 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.44 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  26.05 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  25.95 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.16 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  29.06 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25.58 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  28 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  29.41 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  30.58 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  25.98 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  24.37 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.02 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.53 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.61 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.56 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  25.89 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  29.15 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.69 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  27.57 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  25.38 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  21.84 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  24.51 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  21.46 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.62 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  25.51 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  25.46 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  26.87 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.56 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.62 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.62 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.62 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  25.66 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  28.08 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.62 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.62 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  25.94 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  24.62 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  24.1 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.98 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.62 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  29.02 
 
 		 210 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  24.52 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.61 
 
 		 209 aa  45.4  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  23.31 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  28.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  27.57 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  22.36 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  24.89 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  22.49 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  25.93 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.54 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  22.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.08 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  25.74 
 
 		 211 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  25.6 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  25.6 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  32.32 
 
 		 217 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  24.07 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  26.9 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.24 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  25.85 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  24.55 
 
 		 267 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>