142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5979 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  100 
 
 		 258 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  73.15 
 
 		 262 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  74.33 
 
 		 268 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  71.65 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  71.65 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  70.5 
 
 		 275 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  70.5 
 
 		 268 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  69.35 
 
 		 266 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  70.11 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  69.38 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  68.73 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  68.73 
 
 		 271 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  64.98 
 
 		 260 aa  358  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  63.95 
 
 		 260 aa  354  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  63.92 
 
 		 260 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  62.06 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  60.7 
 
 		 261 aa  339  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  62.45 
 
 		 263 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  61.26 
 
 		 262 aa  332  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  60.16 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  60 
 
 		 262 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  48.05 
 
 		 253 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  45.88 
 
 		 270 aa  230  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  48.05 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  44.92 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  45.35 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  44.02 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  41.47 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  40.62 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  39.61 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  37.25 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  36.68 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.12 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.74 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  28.02 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  29.9 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.02 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  31.68 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  24.81 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.14 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  31.19 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  27.19 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  24.51 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  24.91 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.87 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.13 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.17 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  25.1 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  29.38 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  24.9 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.32 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  25.19 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.9 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  26.98 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  27.1 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  23.6 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.23 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  23.79 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.13 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.23 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  24.82 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  27.72 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.38 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.04 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  24.02 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  23.44 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  23.74 
 
 		 329 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  24 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.74 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  23.72 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  23.72 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.74 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  23.72 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  23.72 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  23.72 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  23.72 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.58 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  29.15 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  23.74 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  23.97 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.61 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  27.67 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  25.48 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  24.53 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  25.94 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  26.18 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  26.18 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  34.81 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  26.77 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  27.07 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  25.35 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  23.85 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.08 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  32.31 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  28.72 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.14 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  22.58 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  25 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  28.22 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>