143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1225 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  100 
 
 		 262 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  63.28 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  61.78 
 
 		 268 aa  331  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  62.5 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  60.62 
 
 		 268 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  62.79 
 
 		 260 aa  322  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  59.07 
 
 		 275 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  60.23 
 
 		 260 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  60.31 
 
 		 259 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  60 
 
 		 258 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  59 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  58.69 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  58.69 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  59.06 
 
 		 262 aa  315  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  60.16 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  58.69 
 
 		 267 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  59.53 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  58.2 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  53.26 
 
 		 266 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  54.12 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  53.12 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  45.74 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  43.75 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  44.57 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  43.8 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  42.41 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  40.54 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  43.85 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  41.63 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  41.92 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  38.22 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  37.24 
 
 		 236 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.57 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.92 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.51 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.39 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  32.02 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  28.38 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  27.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  31.16 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  32.58 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  31.63 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  27.95 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  27.95 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.41 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.64 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.36 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.95 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.37 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  25.97 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.95 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  25.29 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  22.69 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  28.96 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.27 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  23.72 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.29 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  28.87 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.51 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26.42 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  32.86 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  26.5 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  25.2 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.02 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  31.37 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  26.51 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  27.14 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.65 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  21.13 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  21.96 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  26.06 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  20.93 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  23.9 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.14 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25.24 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  27.32 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.73 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  26.43 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  25.58 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  28.63 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  23.38 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  23.14 
 
 		 203 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  23.85 
 
 		 329 aa  48.9  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  24.76 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  21.74 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  25.48 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.94 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  25.28 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  26.94 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  24.82 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.58 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  26.13 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>