223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3853 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  100 
 
 		 193 aa  367  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  48.51 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  47.6 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  44.02 
 
 		 377 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  42.42 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  39.23 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  46.15 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  42 
 
 		 215 aa  121  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  39.72 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  39.5 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  41.21 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  38.14 
 
 		 226 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  38.14 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  38.89 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  36.63 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  38.38 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  36.73 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  33.17 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  35.32 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  31.16 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  37.44 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  36.76 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  34.02 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  34.83 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  36.87 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30.69 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  34.69 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  31.82 
 
 		 215 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  35.26 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  30.69 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  38.14 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  29.38 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  31.8 
 
 		 238 aa  88.2  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  30.2 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  30.2 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.41 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  30.2 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.66 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  30.2 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  33.85 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  30.2 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  35.15 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  34.16 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  30.2 
 
 		 210 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  39.11 
 
 		 249 aa  85.9  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  31.28 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  29.9 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  29.9 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  29.7 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  29.7 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  29.7 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  30.3 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  28.06 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  27.66 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  28.65 
 
 		 216 aa  84.3  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  34.69 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  34.17 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  34.69 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  34.97 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  34.97 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  34.43 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  35.56 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  33.66 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  34.18 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  35.82 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  34.69 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  32.99 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  36.36 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  34.18 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  31.94 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  26.8 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  34.3 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  26.76 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  33.16 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  31.19 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  33.01 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  34.98 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  33.67 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  34.98 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  38.64 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  27.85 
 
 		 290 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  35.86 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  29.47 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  33.5 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  39.34 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  32.84 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  32.78 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  28.24 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  32.24 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  26.32 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  32.81 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  29.44 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  36 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  34.93 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>