235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1722 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  400  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  34.15 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  39.71 
 
 
219 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  37.44 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  40.38 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  37.98 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  32.09 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  36.49 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  38.25 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  40.19 
 
 
217 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  35.41 
 
 
220 aa  122  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  30.39 
 
 
210 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  39.9 
 
 
216 aa  121  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  30.39 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  38.97 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  30.39 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  30.39 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  34.13 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  37.13 
 
 
217 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  34.12 
 
 
210 aa  119  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  30.39 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  30.39 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  30.88 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  30.39 
 
 
210 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  29.41 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  34.47 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  29.9 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  35.41 
 
 
214 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  38.28 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  36.65 
 
 
377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  34.3 
 
 
212 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  35.26 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  32.51 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  33.82 
 
 
227 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  36.36 
 
 
213 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  33.66 
 
 
237 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  33.66 
 
 
226 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.68 
 
 
226 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  39.52 
 
 
210 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.69 
 
 
226 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29.61 
 
 
216 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  33.18 
 
 
210 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  34.51 
 
 
224 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  33.65 
 
 
215 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  30.2 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  35.24 
 
 
229 aa  99  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  35.07 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.21 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  32.38 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  26.57 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  26.57 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  31.55 
 
 
209 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  35.26 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  30.62 
 
 
209 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  30.62 
 
 
209 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  31.1 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  31.5 
 
 
209 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  26.2 
 
 
238 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  31.16 
 
 
294 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  30.22 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  30.22 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  25.24 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  30.35 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  30.62 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  30.62 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.72 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  31.34 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  30 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  30.39 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  27.46 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  33.99 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  33.5 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  25.68 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  30.58 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  33.5 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  33.5 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  31.84 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  33.5 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  29.85 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  29.85 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  30.58 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  31.55 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  33.65 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  30.85 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  33.99 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  29.3 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  27.89 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  33 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  33.17 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  29.41 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  31.43 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  27.36 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  25.96 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  33 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  25.93 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  30.73 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  24.44 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  27.72 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  32.86 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>