171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2438 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  83.09 
 
 
216 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  74.89 
 
 
221 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  77.18 
 
 
209 aa  311  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  72.64 
 
 
217 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  65.53 
 
 
223 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  57.08 
 
 
219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  57.62 
 
 
213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  58.45 
 
 
213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  59.42 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  57.97 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  57.97 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  57.14 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  57.14 
 
 
213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  57.14 
 
 
213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  56.8 
 
 
213 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  57.14 
 
 
213 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  57.28 
 
 
213 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  57 
 
 
209 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  55.5 
 
 
212 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  55.56 
 
 
212 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  55.56 
 
 
242 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  55.07 
 
 
213 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  55.07 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  55.07 
 
 
213 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  55.07 
 
 
213 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  55.56 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  55.07 
 
 
213 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  55.07 
 
 
255 aa  215  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  54.37 
 
 
209 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  50.47 
 
 
209 aa  198  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  48.11 
 
 
209 aa  191  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  37.62 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  37.62 
 
 
209 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  37.62 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  37.13 
 
 
209 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  37.62 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  42.51 
 
 
201 aa  141  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  37.13 
 
 
209 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  36.63 
 
 
209 aa  141  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  37.86 
 
 
209 aa  141  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  36.14 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  36.14 
 
 
209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  36.14 
 
 
209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  42.57 
 
 
200 aa  131  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  37.44 
 
 
213 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  35.35 
 
 
215 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  31.75 
 
 
210 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  38.57 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  33.65 
 
 
205 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  32.86 
 
 
213 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  32.85 
 
 
209 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  31.88 
 
 
208 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  31.88 
 
 
208 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  32.51 
 
 
226 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.94 
 
 
215 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  32.84 
 
 
204 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  34.31 
 
 
203 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.21 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  31.53 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  31.86 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  33.33 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  30.73 
 
 
190 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  32.06 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  32.06 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  31.02 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  31.55 
 
 
209 aa  91.7  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  32.35 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.19 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  28.77 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  30.62 
 
 
209 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  30.22 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  32.41 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  32.35 
 
 
192 aa  85.5  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  31.88 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  33.95 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  33.65 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.65 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  29.95 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.14 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.55 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  33.18 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.6 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.31 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.95 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  28.99 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  32.95 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  25.6 
 
 
268 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  34.34 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  29.61 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.25 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  33.18 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  31.1 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  31.39 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  30.73 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  28.12 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  32.22 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.19 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  27.75 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  29.15 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>