160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3018 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  63.38 
 
 		 221 aa  264  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  65.53 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  64.42 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  58.41 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  62.02 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  57 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  57 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  59.02 
 
 		 209 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  57.56 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  58.54 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  58.05 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  57.07 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  57.56 
 
 		 213 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  57.07 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  57.07 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  57.07 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  57.07 
 
 		 213 aa  225  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  59.42 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  56.1 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  56.1 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  55.34 
 
 		 209 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  55.98 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  55.61 
 
 		 242 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  55.12 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  55.12 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  55.12 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  55.61 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  55.12 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  55.12 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  45.63 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  45.41 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  42.58 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  42.11 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  42.11 
 
 		 209 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  42.11 
 
 		 209 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  42.11 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  41.63 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  41.63 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  41.95 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  41.95 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  38.5 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  39.02 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  35.32 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  32.87 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  33.17 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  31.71 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  31.03 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  34.76 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.02 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  33.65 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  33.65 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  30.58 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.1 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  32.23 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  34.12 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  34.74 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  30.29 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  32.34 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  28.64 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  28.16 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  29.27 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  30.54 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.84 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  31.28 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  29.13 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  28.71 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  33.97 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  29.86 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  29.86 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  26.14 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.55 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.33 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.62 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  30.21 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.7 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  28.92 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.64 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  28.5 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.27 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  32.57 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.97 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.57 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  25.45 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.32 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.92 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.14 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  27.14 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  28.77 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  28.96 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  29.05 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  23.17 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.06 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  28.11 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  29.86 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>