213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0520 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  100 
 
 
268 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  44.92 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  42.62 
 
 
280 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  36.12 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  35.75 
 
 
237 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  35.47 
 
 
268 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  38.03 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  37.61 
 
 
275 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  37.18 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  42.86 
 
 
273 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  34.48 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  35.91 
 
 
257 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  35.29 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  40.84 
 
 
319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  39.58 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  39.58 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  34.02 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  33.2 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  33.06 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  33.97 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  35.75 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  33.82 
 
 
259 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  36.95 
 
 
258 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  31.45 
 
 
262 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  32.23 
 
 
249 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  33.21 
 
 
264 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  34.01 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  33.93 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  34.13 
 
 
259 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  36.46 
 
 
269 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  34.62 
 
 
270 aa  118  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  30.27 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  32.4 
 
 
287 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  31.6 
 
 
267 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  32.81 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  31.54 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  34.8 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  33.06 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  31.88 
 
 
231 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  33.84 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  30.34 
 
 
260 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  29.17 
 
 
244 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
244 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  29.27 
 
 
248 aa  105  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  30.39 
 
 
247 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  29.9 
 
 
250 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  29.9 
 
 
250 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  30.92 
 
 
244 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  28.33 
 
 
243 aa  98.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  28.03 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.79 
 
 
213 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  29.27 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  30.85 
 
 
251 aa  92.4  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  28.46 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.54 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  26.21 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  28.16 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  26.89 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  26.56 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  28.8 
 
 
220 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  27.69 
 
 
209 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  27.43 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  25.94 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  25.94 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  26.16 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  28.27 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  26.58 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  26.58 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  26.58 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  29.41 
 
 
213 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  26.58 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  27.31 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.03 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.3 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  27.76 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  27.31 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  26.5 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  27.89 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  28.69 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  26.57 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  26.16 
 
 
209 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.09 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  27.97 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  25.74 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.22 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  26.47 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  28.99 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  27.5 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  27.73 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  27.73 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  25.74 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  26.41 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.42 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.25 
 
 
214 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  29.38 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.36 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.78 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.77 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  26.05 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  24.68 
 
 
201 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>