85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5760 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  100 
 
 		 310 aa  620  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  88.19 
 
 		 308 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  76.24 
 
 		 320 aa  441  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  60.7 
 
 		 306 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  59.19 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  37.79 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  39.38 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  39.84 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  36.43 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  36.69 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  34.26 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  35.23 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  35.23 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  33.2 
 
 		 247 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  32.78 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  32.61 
 
 		 261 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  33.85 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  33.47 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  32.67 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  34.97 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  31.75 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  30.08 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  31.91 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  31.35 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  34.16 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  34.16 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  33.5 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.91 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  33.66 
 
 		 269 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  29.39 
 
 		 268 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  32.66 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  29.6 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  32.42 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  26.02 
 
 		 220 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  30.71 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  29.95 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  25.28 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  27.21 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  29.69 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  32.45 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  31.75 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  27.27 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  29.48 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  31.51 
 
 		 230 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  32.28 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  28.85 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  30.27 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  31.79 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  30.36 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  30.89 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  30.21 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  29.17 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  28.68 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  30.16 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  27.13 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  30.39 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  26.85 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  25.19 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  26.54 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  23.53 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  21.63 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  28.19 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.73 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.73 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  23.73 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  23.73 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  23.73 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  25.48 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  23.73 
 
 		 210 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  23.73 
 
 		 210 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  23.73 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  23.73 
 
 		 210 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.57 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.49 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  27.92 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.38 
 
 		 216 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.31 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.26 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  31.58 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  24.37 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  20.26 
 
 		 215 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  23.9 
 
 		 215 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  26.44 
 
 		 213 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>