156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3341 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  41.06 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  41.63 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  42.63 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  41.83 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  41.6 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  37.5 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  38.15 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  40.42 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  39.92 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  38.4 
 
 		 251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  38.62 
 
 		 308 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  38.27 
 
 		 247 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  36.63 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  36.63 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  38.14 
 
 		 244 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  38.68 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  34.26 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  33.47 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  32.47 
 
 		 220 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  32.93 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  30.65 
 
 		 261 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.06 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.06 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  31.91 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  31.91 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 		 272 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  32.4 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  29.24 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  30.64 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  29.03 
 
 		 270 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  29.44 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  30.64 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  29.41 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  30.42 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  29.88 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  28.52 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  25.96 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  30.8 
 
 		 231 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.76 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  27.5 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  28.4 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  27.43 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  29.17 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  26.16 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  24.58 
 
 		 237 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  27.62 
 
 		 268 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  27.73 
 
 		 267 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  25.74 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.35 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  27.62 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  26.14 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  28.93 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  29.02 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  26.72 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  27.94 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  31.72 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  27.73 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.32 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  27.02 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.32 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.32 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.88 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.88 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.67 
 
 		 210 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.67 
 
 		 210 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.67 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.67 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.67 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  29.33 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  28.21 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  28.07 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  25.71 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  31.34 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.04 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  31.34 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  25.71 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.88 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  29.14 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  38.89 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.99 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26.34 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  28.57 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  25.64 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  28.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.44 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.58 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.7 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  23.48 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  25.71 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  25.51 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.48 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  25.89 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  22.78 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  24.17 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  26.67 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  25.89 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  27.64 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  25 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>