167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0564 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  54.62 
 
 		 265 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  50.87 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  40.91 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  37.25 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  36.13 
 
 		 268 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  30.29 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  30.13 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.88 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  32.05 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  28.74 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  29.17 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  32.05 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  32.77 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  31.19 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  32.05 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  34.43 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  30.17 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  30.68 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  34.35 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  31.47 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  32.23 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  30.2 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  31.09 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  26.27 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  27.13 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  29.25 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  32.74 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  26.91 
 
 		 231 aa  95.5  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  32.2 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  29.6 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.36 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  28.4 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  27.82 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  29.25 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  23.77 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  30.4 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.65 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  27.02 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  30.52 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  29.96 
 
 		 319 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  25.82 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  28.17 
 
 		 270 aa  88.6  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  28.44 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  26.18 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  35.29 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  28.17 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  31.78 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  30.73 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  24.79 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  32.52 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.08 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  32 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  29.22 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  23.95 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  23.95 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  22.78 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28.03 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  30.74 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  27.13 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.96 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.06 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.37 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  27.97 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  24.47 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  25.97 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  31.48 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  27.92 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  25 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  23.95 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  25.1 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  28.33 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  27.31 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.66 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  25 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  27.47 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  23.85 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  29.83 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  27.71 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  27.35 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.05 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.1 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.65 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  24.69 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  26.81 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  23.23 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  27.71 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  27.83 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  27.27 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  24.76 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  26.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  26.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  27.27 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  25.14 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  28.51 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.78 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  27.63 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>