233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4071 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  39.38 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  41.35 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  46.15 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  37.61 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  35.58 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  41.44 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  41.01 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  36.67 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  37.74 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  33.49 
 
 		 213 aa  111  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  35.89 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  31.43 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  36.36 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  37.91 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  35.27 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  35.58 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  31.43 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  30.95 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  35.68 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  30.95 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  30.95 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  30.95 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  30.95 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  33.77 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  30.95 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  39.32 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  30.95 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  30.95 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  39.81 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  31.96 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  37.25 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  37.02 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  37.32 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  33.33 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  36.24 
 
 		 377 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  37.09 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  35.07 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  31.58 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  37.02 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  32.06 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  34.63 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  33.33 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  31.13 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  33.64 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  33.18 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  31.38 
 
 		 294 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  36.08 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  31.82 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  31.16 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  33.18 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 		 272 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30.56 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  36.45 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  35.57 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  32.56 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  32.56 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  33.65 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  32.71 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  29.95 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  33.18 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  33.8 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  36.45 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  36.59 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  33.33 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  32.24 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  34.76 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  35.61 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  32.84 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  33.33 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  32.54 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  32.86 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  32.86 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  27.56 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  32.86 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  31.78 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  26.54 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.32 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  33.17 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  26.54 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  35.98 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  29.46 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  29.65 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  28.65 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  32.83 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.7 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  26.24 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  34.91 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  33.33 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  33.93 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  35.05 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  33.33 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.94 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  26.24 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  32.86 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.1 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  29.59 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  33.8 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  29.59 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>