225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0257 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  58.59 
 
 
210 aa  228  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  49.26 
 
 
204 aa  202  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  41.83 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  40.57 
 
 
226 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  38.86 
 
 
210 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  40.76 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  39.62 
 
 
226 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  37.75 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  36.45 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  35.58 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  35.58 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  38.21 
 
 
226 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  36.41 
 
 
208 aa  123  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  36.41 
 
 
208 aa  123  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  37.68 
 
 
209 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  43.03 
 
 
216 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  35.27 
 
 
209 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  32.68 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  32.84 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  36.02 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  33 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  35.68 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  32.51 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  32.51 
 
 
209 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  32.51 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  37.74 
 
 
217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  32.02 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  32.02 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  34.8 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  37.36 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  36.49 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  32.51 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  32.51 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  38.1 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  34.8 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  34.8 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  36.52 
 
 
238 aa  112  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  33.99 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  34.31 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  32.02 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  33.82 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  33.98 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  34.31 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  34.8 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  35.41 
 
 
211 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  31.53 
 
 
209 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  33.5 
 
 
213 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  36.76 
 
 
190 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  33.97 
 
 
255 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  35.29 
 
 
209 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  34.78 
 
 
213 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  33.01 
 
 
209 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  34.31 
 
 
212 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  33.66 
 
 
219 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  34.31 
 
 
212 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  32.55 
 
 
213 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  33.49 
 
 
242 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  31.71 
 
 
223 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  34.63 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  34.63 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  34.63 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  34.29 
 
 
242 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  34.63 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  36.84 
 
 
216 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  33.33 
 
 
209 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  35.29 
 
 
200 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  34.63 
 
 
242 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  34.31 
 
 
223 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  31.37 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  32.21 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  32.86 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  31.82 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  35.64 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.14 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  32.56 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  32.24 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  32.55 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  32.77 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.84 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  33.82 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  34.63 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  33.82 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  31.1 
 
 
217 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  30.58 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  31.86 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  29.13 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27.91 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  29.13 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  33.01 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  28.64 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  28.64 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.64 
 
 
210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  28.16 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.64 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  30.35 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  28.05 
 
 
243 aa  85.5  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  30.43 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  30.99 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  28.16 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>