241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3555 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  96.9 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  59.29 
 
 		 237 aa  287  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  57.08 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  55.95 
 
 		 227 aa  271  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  44.66 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  44.66 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  43.63 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  44.93 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  43.75 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  40.76 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  42.65 
 
 		 209 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  44.06 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  41.18 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  41.18 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  40.49 
 
 		 213 aa  158  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  41.18 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  36.82 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  36.82 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  38.89 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  36.82 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  36.82 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  36.82 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  36.82 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  36.32 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  39.02 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  35.82 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  36.95 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  39.62 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  35.96 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  37.8 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  35.64 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  36.32 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  33.33 
 
 		 255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  34.31 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  33.81 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  34.31 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  34.31 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  34.31 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  33.98 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  33.5 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  33.33 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  34.91 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  32.37 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  32.2 
 
 		 209 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  36.27 
 
 		 190 aa  121  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  33.33 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  31.19 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  35.44 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  31.19 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  31.19 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  35.41 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  31.19 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  31.68 
 
 		 212 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  31.68 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  38.12 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  30.69 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  30.69 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  30.88 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  34.43 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  33.17 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  36.12 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  30.2 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  35.24 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  35.07 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  30.85 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  30.35 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  32.54 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  30.58 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  31.48 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  31.22 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  30.92 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  32.2 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  32.06 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  30.58 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  33.01 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  33.5 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  33.63 
 
 		 377 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  30.85 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  33.33 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  29.36 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  30.69 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  31.16 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  28.23 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  32.08 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  38.14 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  31.07 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  35.38 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  33.17 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.75 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.75 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.75 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  27.75 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  27.75 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  31.34 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  31.34 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>