215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2272 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  65.12 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  62.6 
 
 		 257 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  65 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  62 
 
 		 257 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  58.66 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  53.36 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  50.97 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  52.05 
 
 		 268 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  46.48 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  47.88 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  49.61 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  45.67 
 
 		 270 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  44.4 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  45.42 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  46.43 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  44.92 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  45.34 
 
 		 259 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  36.82 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  37.35 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  36.93 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  35.56 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  35.56 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  34.96 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  33.87 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  42.41 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  33.87 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  33.2 
 
 		 268 aa  131  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  35.27 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  37.63 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  32.52 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  34.31 
 
 		 249 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  34.31 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  123  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  32.53 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  37.23 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  32.66 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  33.66 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  30.5 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  30.53 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  35.6 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  32.77 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  35.83 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  29.88 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  31.38 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  36.22 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  34.85 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  33.87 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  29.71 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  28.1 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  29.29 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  32.21 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  34.18 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  32.92 
 
 		 220 aa  92.8  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  30.68 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  27.73 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  31.43 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  28.23 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  28.23 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.23 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.64 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  33.74 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.83 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.83 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.42 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.42 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.42 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  32.99 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.53 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  29.63 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  28.33 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.6 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.99 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  28.18 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  29.1 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  26.4 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  31.87 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  28.57 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  33.33 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  30.89 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  31.95 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.34 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  35.23 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.58 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.29 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  27.62 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  27.08 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.41 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  30.93 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  23.11 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.03 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  28.91 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  30.96 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  29.37 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  30.53 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  26.34 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  27.63 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>