185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2933 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  100 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  52.92 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  47.64 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  46.78 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  37.93 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  38.2 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  38.66 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  35.47 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  38.82 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  38.4 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  41.92 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  39.84 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  37.2 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  37.82 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  40.17 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  37.82 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  37.2 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  39.83 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  37.77 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  36.4 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  42.42 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  36.69 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  34.35 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  42.41 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  36.59 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  34.35 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  34.35 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  38.5 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  36.59 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  39.6 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  38.06 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  34.05 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  34.57 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  36.51 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  36.13 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  33.04 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  38.69 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  35.83 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  33.88 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  32.75 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  38.19 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  33.04 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  36.21 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  37.19 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  29.26 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  32.47 
 
 		 265 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  30.9 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  36.13 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  35.18 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  41.36 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  28.02 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  36.51 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  28.45 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  29.79 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  30.61 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  27.66 
 
 		 220 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  27.62 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  29.39 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  28.94 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.11 
 
 		 213 aa  92  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  30.7 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  29.79 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  29.8 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.69 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  36.24 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.43 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  28.64 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.9 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  33.68 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.43 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.42 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  22.59 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  26.52 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  30.88 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.26 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.81 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  23.58 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  23.58 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  23.58 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.45 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  23.58 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  26.43 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  26.9 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  23.58 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  29.13 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.94 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  30.8 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  23.04 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.04 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.48 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  24.65 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.41 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  25 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  26.32 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  27.83 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  25.32 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  28.71 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  27.69 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>