71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1384 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  74.92 
 
 
303 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  63.1 
 
 
308 aa  339  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  61.45 
 
 
320 aa  332  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  62.36 
 
 
310 aa  324  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  38.19 
 
 
287 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  39.92 
 
 
249 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  38.78 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  36.4 
 
 
244 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  35.8 
 
 
251 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  38.21 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  38.21 
 
 
248 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  38.1 
 
 
243 aa  135  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  34.9 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  34.9 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  34.39 
 
 
247 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  36.51 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  36.14 
 
 
249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  31.9 
 
 
261 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  33.76 
 
 
244 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  31.65 
 
 
220 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  32.46 
 
 
264 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  32.05 
 
 
272 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  27.97 
 
 
319 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  29.79 
 
 
268 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.91 
 
 
275 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  31.73 
 
 
280 aa  99  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  31.17 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  30.3 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  31.43 
 
 
260 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.87 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  32.38 
 
 
258 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  30 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  30 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  31.71 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  29.55 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  29.34 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  30.28 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  29.48 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.1 
 
 
280 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  28.52 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  29.13 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  29.03 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  24.89 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  27.89 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  29.71 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  29.59 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  27.82 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  29.63 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  30.65 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  29.63 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  29.39 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  25.66 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  26.57 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  29.1 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  29.72 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  24.38 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  29.25 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  25.93 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  26.91 
 
 
256 aa  62.4  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.89 
 
 
213 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  23.11 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  24.36 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  24.26 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  23.5 
 
 
233 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  24.19 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  26.13 
 
 
217 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  23.58 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  23.53 
 
 
216 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  22.68 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  22.94 
 
 
210 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>