83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01310 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 251 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  45.34 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  45.34 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  44 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  41.7 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  44.81 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  42.62 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  43.62 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  41.2 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  43.33 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  40.08 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  42.5 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  46.52 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  38.4 
 
 		 287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  33.75 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  33.61 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  35.8 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  35.04 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  34.44 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  33.2 
 
 		 320 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  36.61 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  36.61 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  33.2 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  35.83 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  37.43 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  32.79 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  32.08 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  36.51 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  33.86 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  31.47 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  31.38 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  33.51 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  34.04 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  34.41 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  30.58 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  32.98 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  31.75 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  32.09 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  31.55 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  29.61 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  31.55 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  28.38 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  29.61 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  29.61 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  32.24 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  30.85 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  29.61 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  31.55 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  32.53 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  32.09 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  25.78 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.15 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  28.57 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  27.78 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  27.62 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.03 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  27.47 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  27.9 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  27.66 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  25 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.27 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.11 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  25.2 
 
 		 377 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27.72 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.87 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  23.46 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  24.89 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  28.4 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  30.5 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  22.78 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  26.75 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  26.2 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.68 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  27.73 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  22.36 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  23.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.41 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  23.91 
 
 		 210 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  23.91 
 
 		 210 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>