146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1793 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  100 
 
 		 267 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  84.96 
 
 		 275 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  83.46 
 
 		 268 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  83.46 
 
 		 268 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  77.9 
 
 		 268 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  77.15 
 
 		 268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  73.28 
 
 		 262 aa  407  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  73.46 
 
 		 271 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  70.99 
 
 		 266 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  70.11 
 
 		 258 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  65.52 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  66.79 
 
 		 259 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  67.68 
 
 		 259 aa  362  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  64.5 
 
 		 260 aa  358  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  60.38 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  59.46 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  56.49 
 
 		 262 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  56.87 
 
 		 261 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  59.38 
 
 		 263 aa  311  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  58.69 
 
 		 262 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  55.81 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  47.48 
 
 		 253 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  47.06 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.97 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  42.47 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  42.21 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  41.54 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  40.34 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  38.35 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  39.15 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  35.77 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  36.29 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.79 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.17 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  27.03 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.47 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.44 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.7 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  28.09 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.51 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  23.7 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  28.37 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25.82 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.05 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  26.67 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.88 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  27.7 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.69 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  27.98 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.4 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  23 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  28 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.67 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  27.83 
 
 		 329 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.02 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  25.37 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  25.44 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.68 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  27.78 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  26.36 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  23.5 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.68 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26.34 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  27.31 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  25.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  25.93 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  26.42 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.15 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.77 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.77 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  28.08 
 
 		 213 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  25.46 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  25.46 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.41 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.77 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.77 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  30.6 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.1 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.77 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  23.86 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  24.32 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.41 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  27.27 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  27.71 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  23.89 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  25.55 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  25.23 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  25.96 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  29.82 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  24.51 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  26.79 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  25.71 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  24.78 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  23.61 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  24.02 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  23.61 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  24.31 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  25.33 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>