103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5975 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  90.3 
 
 		 275 aa  510  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  83.46 
 
 		 267 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  77.99 
 
 		 268 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  76.49 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  72.9 
 
 		 262 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  72.69 
 
 		 271 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  71.65 
 
 		 258 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  70.61 
 
 		 266 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  68.32 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  65.12 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  67.68 
 
 		 259 aa  359  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  64.23 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  63.36 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  60.38 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  58.4 
 
 		 261 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  60.7 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  57.59 
 
 		 262 aa  315  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  58.69 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  56.54 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  45.15 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  44.73 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  41.31 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.97 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  41.38 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  41.31 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  40.68 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  40.76 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  37.45 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  36.78 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  40.67 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  26.32 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.69 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  24.71 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.53 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  32.87 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.29 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  25.62 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25.23 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.11 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  26.38 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25.45 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.5 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  28.37 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.73 
 
 		 217 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  26.11 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  26.38 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.29 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  23.23 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.39 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  22.89 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.21 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  27.23 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.02 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  27.59 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  26.67 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  22.89 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25 
 
 		 210 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  27.57 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.79 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.13 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  26.32 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  23.29 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.78 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.78 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  23.74 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  33.81 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  23.77 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  24.78 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.78 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.78 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  27.47 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  24.56 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  33.81 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  28.76 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.98 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.83 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.78 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  29.44 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  23.31 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  26.5 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.61 
 
 		 210 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  25.94 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  33.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  25.12 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  25.51 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  23.46 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  24.9 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  24.9 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  23.94 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.2 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  27.39 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  23.08 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  24.54 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  24.54 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  28.9 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>