95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0716 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  76.36 
 
 		 259 aa  424  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  73.95 
 
 		 271 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  69.58 
 
 		 268 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  68.73 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  67.3 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  69.38 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  68.06 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  67.68 
 
 		 267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  67.68 
 
 		 268 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  67.68 
 
 		 268 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  62.55 
 
 		 260 aa  352  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  63.78 
 
 		 262 aa  345  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  62.84 
 
 		 266 aa  345  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  63.81 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  59.85 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  61.48 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  59.38 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  56.76 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  60.31 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  55.47 
 
 		 258 aa  298  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  46.3 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.69 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  44.31 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  44.88 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  41.63 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  43.35 
 
 		 283 aa  194  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  43.7 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  40 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  42.21 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  40.29 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  35.02 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.5 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.89 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  28.91 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.93 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.47 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  31 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.14 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.08 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.9 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.98 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  27.93 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  28.71 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.51 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.98 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.36 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  27.41 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31.22 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.13 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  25.24 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.22 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  27.03 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  24.65 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  28.31 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  26.22 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.15 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  26.73 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  24.87 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  27.92 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  24.09 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.49 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.67 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.21 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  27.41 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  23.86 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  30.59 
 
 		 193 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  33.15 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  24.22 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  26.96 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  27.84 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  25.64 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  28.47 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  25.64 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25.63 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26.32 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  26.4 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  30.61 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  23.92 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  23.92 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  24.42 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  24 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.15 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  30.47 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  27.31 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  27.31 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  25.68 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  26.17 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  28.5 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  23.35 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  25.64 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  24.41 
 
 		 215 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  27.84 
 
 		 209 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>