114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1005 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  70.99 
 
 		 267 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  69.35 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  69.08 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  67.94 
 
 		 268 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  70.61 
 
 		 268 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  70.61 
 
 		 268 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  68.7 
 
 		 268 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  67.69 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  65.52 
 
 		 271 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  64.23 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  63.98 
 
 		 259 aa  348  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  62.84 
 
 		 259 aa  345  5e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  59 
 
 		 260 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  60.38 
 
 		 260 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  58.85 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  58.46 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  57.53 
 
 		 262 aa  321  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  56.92 
 
 		 261 aa  321  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  58.75 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  53.26 
 
 		 262 aa  298  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.92 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  46.54 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  43.97 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  41.98 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  40 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  40.15 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  39.23 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  38.58 
 
 		 287 aa  185  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  36.78 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  42.11 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  37.62 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  28.37 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.41 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.09 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.69 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  26.92 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  24.33 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  25.19 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  24.81 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.41 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.82 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.27 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  23.02 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  22.86 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.52 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  27.42 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  25.85 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  23.71 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  23.71 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.93 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  23.93 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  23.71 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  23.93 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  21.9 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.24 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  25.11 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  23.28 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  23.28 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  22.05 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  25.19 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  20.49 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.5 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  26.48 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.06 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  23.9 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  25.35 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  25.35 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  25 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  23.79 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  26.96 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.66 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.03 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  27.94 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  24.89 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  23.66 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  23.11 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  20.67 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  23.7 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  25.64 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  25.5 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  22.03 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  24.37 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.76 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  26.05 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  23.33 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  23.04 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  24.88 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  24.75 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  31.41 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  25.91 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  21.07 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  26.67 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  20 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  22.12 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  24.54 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  24.54 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>