175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1541 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  100 
 
 		 253 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  97.23 
 
 		 253 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  52.94 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  50.2 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  48.05 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  48.83 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  48.05 
 
 		 287 aa  240  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  47.45 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  46.09 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  45.7 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  46.54 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  45.98 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  46.09 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  47.06 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  44.36 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  45.67 
 
 		 262 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  47.06 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  46.3 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  45.59 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  45.91 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  45.35 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  46.25 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  44.12 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  42.91 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  44.73 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  44.73 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  44.02 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  43.8 
 
 		 262 aa  215  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.17 
 
 		 270 aa  215  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  44.31 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  42.35 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  46.15 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.56 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  28.94 
 
 		 233 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.02 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.51 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  33.33 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.44 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.07 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  31.19 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.37 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  28.65 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  30.35 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.92 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  30.4 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.5 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.15 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.98 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.8 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  32.46 
 
 		 216 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  29.33 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  28.32 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28.08 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  31.34 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  25.89 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.81 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.35 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.21 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.42 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  31.82 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.67 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.67 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.67 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.67 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  29.9 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.58 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.67 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.02 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.4 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  29.85 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  29.47 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.36 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.25 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.39 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25.12 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.04 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  29.72 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.9 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  26.94 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  26.11 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.76 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  31.7 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  22.5 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  34.11 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  24.38 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  26.44 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  26.44 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  28.78 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  26.09 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.38 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.23 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  27.32 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  28.85 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  24.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  24.81 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  24.24 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  28.92 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  28.7 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>