204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0367 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  64.02 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  58.98 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  54.48 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  47.06 
 
 		 270 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  42.64 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  40.58 
 
 		 342 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  37.09 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  38.05 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  38.31 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  36.21 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  32.82 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  33.07 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  32.43 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  33.33 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  29.63 
 
 		 312 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  30.23 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  30.23 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  31.84 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  33.46 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  30.12 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  30.12 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  34.84 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  34.21 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  34.76 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  34.85 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  34.55 
 
 		 329 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  34.55 
 
 		 329 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  34.55 
 
 		 329 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  31.3 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  31.3 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  33.93 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  32.03 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  33.18 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  36.62 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  35.11 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  32.27 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  35.23 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  30.48 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  32.73 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  33.57 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  31 
 
 		 331 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  32.38 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  29.85 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  33.97 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  31.43 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  31.7 
 
 		 398 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  31.82 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.48 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  28.99 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  31.7 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  27.56 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  33.18 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  29.75 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  28.57 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  29.34 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  30.51 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  30.47 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  32.42 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.73 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  30.34 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  30.34 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.02 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  34.12 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  34.12 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  34.12 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  34.12 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  27.54 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  34.12 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  26.67 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  30.17 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  25.67 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31.35 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  29.39 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  37.7 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  26.52 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  28.74 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.7 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  26.44 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  32.35 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  32.35 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  29.63 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  29.93 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  29.78 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  27.15 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.73 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  27.88 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  26.69 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  26.64 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.86 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  29.79 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.3 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  30.49 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  26.35 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  24.14 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.14 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.02 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.55 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>