84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2868 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  78.73 
 
 		 327 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  68.25 
 
 		 320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  68.01 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  65.08 
 
 		 320 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  64.56 
 
 		 322 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  34.43 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  34.43 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  34.43 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  36.69 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  34.8 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  36.91 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  32.44 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  35.18 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.22 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  34.07 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  34.87 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  33.12 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  31.49 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  29.32 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  28.82 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  31.01 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  28.25 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  30.92 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  30.41 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  30.41 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  30.41 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  30.41 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  29.62 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  30.41 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  30.9 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  29.48 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  28.99 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  26.52 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  28.93 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  28.93 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  28.61 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  27.4 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  27.89 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  27.7 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  28.16 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  27.48 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  28.4 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  26.29 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  28.71 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  29.3 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  27.51 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  32.03 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  27.15 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  28.37 
 
 		 372 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.74 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  27.04 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  29.91 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  29.91 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.74 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  27.09 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  27.45 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  26.8 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  32.86 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  26.11 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  26.4 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  29.27 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  27.86 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  25.58 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  25.73 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  30.23 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  27.01 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  29.12 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  21.64 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  31.75 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  30.05 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  30.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  30.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  30.05 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  25.45 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  27.01 
 
 		 209 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>