85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4678 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  697    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  69.64 
 
 
340 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  58.65 
 
 
341 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  57.06 
 
 
372 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  56.64 
 
 
342 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  56.98 
 
 
352 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  55.36 
 
 
348 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  54.18 
 
 
356 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  55.72 
 
 
342 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  54.73 
 
 
350 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  53.12 
 
 
352 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  54.12 
 
 
362 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  54.12 
 
 
362 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  53.82 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  51.3 
 
 
342 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  50.44 
 
 
345 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  50.15 
 
 
336 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  50.15 
 
 
335 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  50.15 
 
 
336 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  50.15 
 
 
344 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  49.56 
 
 
336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  49.56 
 
 
335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  50 
 
 
354 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  49.7 
 
 
340 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  50.51 
 
 
248 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  50.51 
 
 
239 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  50.51 
 
 
248 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  50.51 
 
 
248 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  46.82 
 
 
209 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  33.14 
 
 
318 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  33.05 
 
 
329 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  33.05 
 
 
329 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  33.05 
 
 
329 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  31.11 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  33.93 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.17 
 
 
332 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  28.82 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  50.76 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  50.76 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  50.76 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  50.76 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
382 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  27.88 
 
 
322 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  31.74 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  29.2 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  32.47 
 
 
344 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  27.84 
 
 
320 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  31.33 
 
 
287 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
337 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  29.59 
 
 
327 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  29.51 
 
 
323 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  26.59 
 
 
320 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  30.24 
 
 
322 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  29.29 
 
 
311 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  28.4 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  27.83 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  25.52 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  25.52 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  29.27 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  26.52 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  28.28 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  28.28 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  27.84 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  26.3 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  58.33 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  26.65 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  29.2 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  26.67 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  25.59 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  30.17 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  25.59 
 
 
329 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  26.67 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  24.27 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  23.8 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  23.8 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  26.63 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  28 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  30.3 
 
 
265 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  25.41 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  27.33 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  29.79 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  26.26 
 
 
270 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>