147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0591 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  50.33 
 
 
329 aa  324  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  50 
 
 
335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  50 
 
 
329 aa  309  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  34.59 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  33.68 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  37.09 
 
 
269 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  29.25 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  35.69 
 
 
267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  29.59 
 
 
312 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  30.85 
 
 
311 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  34.07 
 
 
280 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  29.25 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  31.35 
 
 
318 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  33.45 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  30.18 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  30.18 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  29.59 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  31.13 
 
 
321 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  31.37 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  28.57 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  32.13 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  28.57 
 
 
351 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  28.57 
 
 
351 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  31.29 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  31.29 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  31.29 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  33.63 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  29.87 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  29.93 
 
 
331 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  31.75 
 
 
344 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  28.85 
 
 
322 aa  106  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  29.22 
 
 
327 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  27.13 
 
 
322 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  30.94 
 
 
307 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  27.6 
 
 
320 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  27.51 
 
 
317 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  27.88 
 
 
398 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  29.43 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  30.72 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  28.8 
 
 
332 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  27.22 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  29.33 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  28.32 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  27.87 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  29.18 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  26.02 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  27.99 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  25.88 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  28.38 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  27.99 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  32.95 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  32.95 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  27.16 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  29.2 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  27.62 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  25.74 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  30.19 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  26.96 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  26.44 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.7 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  26.41 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  32.71 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  28.36 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  26.41 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.24 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  26.61 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  27.34 
 
 
233 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  27.34 
 
 
233 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  27.19 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  26.91 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  24.92 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.73 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
347 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  24.92 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  24.92 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  24.92 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  26.12 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  29.95 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  27.59 
 
 
353 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  22.86 
 
 
213 aa  59.3  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  24.92 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  25.52 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28.96 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  26.43 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  26.29 
 
 
283 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  25.85 
 
 
256 aa  56.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.64 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  24.18 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  25 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  25.99 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  26.02 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  26.07 
 
 
210 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  27.35 
 
 
260 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  26.91 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  26.99 
 
 
201 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  22.71 
 
 
291 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>