82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5324 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  34.44 
 
 
329 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  34.44 
 
 
329 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  34.44 
 
 
329 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.61 
 
 
332 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  31.52 
 
 
332 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  36.13 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  33.33 
 
 
344 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  32.18 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  30.09 
 
 
318 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  33.33 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  26.02 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  28.19 
 
 
320 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  28.13 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  26.58 
 
 
320 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  26.23 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  30.91 
 
 
321 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  29.14 
 
 
327 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  28.17 
 
 
309 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  29.43 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  31.11 
 
 
269 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  34.9 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  30.39 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  32.19 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.67 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  26.32 
 
 
315 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  26.64 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  28.74 
 
 
340 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  27.95 
 
 
352 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  32.86 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  26.23 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  26.4 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  27.49 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  27.49 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  27.49 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  27.49 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  27.49 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  28.29 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  30.59 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  33.02 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  27.88 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  23.47 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  25.41 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  34.13 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  26.87 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  25.28 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  24.18 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  24.18 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  23.9 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  23.9 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  31.73 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  22.48 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  22.45 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.96 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  22.73 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  22.73 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  24.27 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  25.22 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  24.86 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  23.85 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  24.64 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  24.38 
 
 
398 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  27.16 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  26.12 
 
 
356 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  24.93 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  24.14 
 
 
342 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  24.35 
 
 
342 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.16 
 
 
249 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  24.85 
 
 
340 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  24.56 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  22.26 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  25.88 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  27.82 
 
 
233 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  28.57 
 
 
233 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  25.93 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>