87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4953 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  69.64 
 
 		 344 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  59.88 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  60.8 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  57.35 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  59.26 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  57.26 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  58.4 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  58.4 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  58.17 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  59.38 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  57.82 
 
 		 342 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  58.05 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  56.56 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  54.07 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  54.26 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  51.16 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  50.88 
 
 		 336 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  50.88 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  50.88 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  50.89 
 
 		 335 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  50.89 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  50.59 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  50.59 
 
 		 340 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  48.77 
 
 		 248 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  48.77 
 
 		 248 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  48.77 
 
 		 248 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  48.77 
 
 		 239 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  51.16 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.66 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  32.37 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  33.43 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  33.43 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  33.43 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  32.24 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  29.24 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  52.27 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  52.27 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  52.27 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  52.27 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  31.98 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  27.86 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  28.14 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  31.76 
 
 		 344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  30.15 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  28.36 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  30.99 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  26.89 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  31.83 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.08 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  29.36 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  28.49 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  28.7 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  24.47 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  24.18 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.72 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.72 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  24.71 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  27.57 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  23.95 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  28.28 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  26.41 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  27.72 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  24.78 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  57.63 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  27.37 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  22.86 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  22.86 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  24.48 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  26.69 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  33.51 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  31.84 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  24.18 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  26.64 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  25.93 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  25.32 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  25.96 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  26.72 
 
 		 398 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  24.18 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  25.8 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  30.41 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  26.84 
 
 		 249 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>