164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5058 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  100 
 
 		 290 aa  603  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  75.46 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  76.63 
 
 		 276 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  31.6 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  28.36 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.9 
 
 		 213 aa  89  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  23.9 
 
 		 219 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.09 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.09 
 
 		 210 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.19 
 
 		 210 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.19 
 
 		 210 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.09 
 
 		 210 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.09 
 
 		 210 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.19 
 
 		 210 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.19 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.79 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.91 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.9 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  30.49 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.31 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  24.26 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  23.79 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  30.43 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  23.69 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  23.13 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  22.71 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  35.61 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  24.8 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  23.58 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  23.67 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.5 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  27.85 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  30.77 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  24.8 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  26.92 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  31.16 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.04 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  28.57 
 
 		 217 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  26.44 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  25.6 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  25.69 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  30.27 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  28.65 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  24.3 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  31.34 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  26.25 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  26.49 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  26.64 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  25.14 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  24.23 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  27.15 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  31.34 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  26.72 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  25.64 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  25.82 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  27.33 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  24.35 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  24.11 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  23.37 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  25.22 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  28.66 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  26.02 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  26.49 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  24.21 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25.75 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  27.27 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  26.13 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  29.09 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  27.93 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  22.71 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  24.15 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  24.11 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  23.93 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  28.19 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  26.13 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  22.45 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  22.5 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  23.56 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  22.82 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  25.81 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  22.82 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  25.81 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  24.02 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  23.7 
 
 		 249 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3386  cyclase family protein  23.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  30.47 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  27.33 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  25.19 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  23.08 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.77 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  25.19 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  22.22 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  23.78 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.09 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  30.53 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  23.97 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  27.67 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  22.87 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  27.46 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>