130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3386 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3386  cyclase family protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  33.63 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  33.63 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  33.63 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  33.19 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  33.63 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  33.63 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  33.19 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  33.19 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  33.63 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  32.3 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  29.02 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.74 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  33.92 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  30.94 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  27.06 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  31.36 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  28.44 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.99 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  32.62 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  28.12 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.87 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.12 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  29.82 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  29.28 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  30.13 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  25.71 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28.83 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.48 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  29.65 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  28.92 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  28.38 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  28.38 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.06 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  28.51 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  28.16 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.95 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  28.8 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  27.57 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  30.49 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  26.5 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.87 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  27.96 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.22 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.78 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.22 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  25.89 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.17 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  34.63 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.23 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  28.38 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.44 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  25.69 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  26.48 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  29.49 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  26.48 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  28.81 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  23.01 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  24.47 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  28.97 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.29 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  25.57 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  26.24 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  22.51 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  23.23 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  26.89 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  27.4 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  26.09 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.51 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.05 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  27.08 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.89 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  24.74 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  27.78 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  26.56 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  26.85 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  26.01 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  23.87 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  25.22 
 
 		 377 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  23.33 
 
 		 290 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  24.1 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  24.3 
 
 		 276 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  22.75 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  25.66 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  28.43 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  28.25 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  23.61 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  25.93 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  29.13 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  36.79 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  27.62 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  25.93 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  25.46 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  28 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  26.98 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  23.42 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  25.53 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  37.37 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  25.46 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  25.46 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>