146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2038 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  100 
 
 
260 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  64.89 
 
 
268 aa  371  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  65.65 
 
 
268 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  64.06 
 
 
260 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  64.23 
 
 
266 aa  359  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  64.5 
 
 
275 aa  359  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  64.5 
 
 
267 aa  358  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  64.98 
 
 
258 aa  358  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  62.79 
 
 
262 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  62.55 
 
 
259 aa  352  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  62.79 
 
 
262 aa  351  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  63.53 
 
 
260 aa  347  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  63.28 
 
 
262 aa  346  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  63.36 
 
 
268 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  63.36 
 
 
268 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  64.75 
 
 
260 aa  344  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  61.92 
 
 
271 aa  344  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  60.85 
 
 
259 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  61.18 
 
 
263 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  58.04 
 
 
258 aa  318  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  56.59 
 
 
261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  47.84 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.48 
 
 
253 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  43.75 
 
 
270 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  45.7 
 
 
253 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  40.39 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  39.69 
 
 
255 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  40.62 
 
 
262 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  41.76 
 
 
283 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  42.08 
 
 
287 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  36.58 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  39.9 
 
 
236 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.02 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.41 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.5 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.3 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.22 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  29.5 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  27.94 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  27.73 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.4 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.33 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.33 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.89 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.89 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.89 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.89 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.65 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.89 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  22.09 
 
 
213 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.68 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28.36 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.89 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  28.11 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.89 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.27 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.32 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.23 
 
 
213 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.21 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.77 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  25.22 
 
 
290 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  25.33 
 
 
276 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  28.64 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.37 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.88 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  24.39 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  26.64 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  29.49 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  26.18 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  27.34 
 
 
377 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  25.94 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.18 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  28 
 
 
211 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  25.7 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.92 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  26.5 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  26.27 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  28.78 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  27.35 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.36 
 
 
219 aa  52  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  26.94 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  27.23 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.55 
 
 
210 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  30.46 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  27.15 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  20.98 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.25 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  21.8 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  27.05 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  25.43 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  27.32 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  26.51 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  21.5 
 
 
189 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.51 
 
 
209 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26 
 
 
205 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  29.35 
 
 
208 aa  49.3  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  25.5 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  31.38 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>