142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0480 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  100 
 
 		 261 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  60.7 
 
 		 258 aa  339  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  60.31 
 
 		 275 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  59.69 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  59.3 
 
 		 259 aa  331  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  58.4 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  58.4 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  56.92 
 
 		 266 aa  321  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  59.53 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  56.76 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  56.87 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  56.2 
 
 		 260 aa  314  9e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  55.77 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  56.59 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  54.58 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  54.2 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  54.51 
 
 		 260 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  53.33 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  54.12 
 
 		 263 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  53.12 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  51.57 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.48 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  46.09 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  46.74 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  42.97 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  43.14 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  40.16 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  41.41 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  38.76 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  37.02 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  39.74 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  42.16 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  26.64 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.87 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  27.72 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  22.92 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.3 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  26.47 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.84 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.56 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.27 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  24.34 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.75 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.34 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.31 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.75 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.23 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.23 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.83 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  23.85 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  27.23 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  22.92 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.1 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.91 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  26.29 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.7 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  30.65 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.23 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  26.38 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  26.38 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  25.18 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.1 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.61 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  26.9 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  25.54 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  25.6 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  26.8 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  24.81 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  22.83 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  24 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  24 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  23.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  24.82 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  28.03 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.88 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.5 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.74 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.36 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  27.6 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  27.6 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  24.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  27.84 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  26.94 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  23.74 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  25.77 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  27.6 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  27.94 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.5 
 
 		 210 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  24.24 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  27.32 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.08 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  27.08 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  26.57 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  23.44 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  26.87 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.95 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>