252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0191 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0191  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1287  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.7 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.19 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.31 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.68 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.88 
 
 		 701 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  26.98 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6424  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.5 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.82 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  24.06 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2165  LytTR family two component transcriptional regulator  27.92 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0607611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.98 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5383  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.69 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.9 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.79 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  24.62 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1645  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.41 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30 
 
 		 635 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  23.35 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.13 
 
 		 471 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.14 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.5 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0764  two component transcriptional regulator, LytTR family  21.46 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  25.9 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  33.63 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  23.58 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5405  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.06 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.379459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.76 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.87 
 
 		 561 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4770  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5598  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.86 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0271  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.33 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.81 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4084  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.22 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.445273  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.28 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  22.39 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  20.6 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1788  response regulator receiver domain-containing protein  32.98 
 
 		 145 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.84 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  23.83 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  22.52 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1441  LytTR family two component transcriptional regulator  27.04 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1220  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.81 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.132093  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 989 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  21.98 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 989 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.79 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  28.43 
 
 		 875 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.9 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1765  putative two-component response-regulatory protein YehT  22.94 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  hitchhiker  0.00544661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  25.13 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  23.11 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  23.08 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 404 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 		 120 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0603  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2279  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.957974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  20.6 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.67 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 953 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  18.42 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11553  two-component system response regulator  21.47 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  19.44 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.9 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3893  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal  0.267267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 465 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2060  two component transcriptional regulator, LytTR family  19.83 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  22.76 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  25.13 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  26.5 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.45 
 
 		 457 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.87 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.25 
 
 		 847 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  22.59 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1804  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 469 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358984  normal  0.379225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  29.57 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.89 
 
 		 426 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  21.2 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6983  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.17 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  23.94 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  20.3 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2242  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.02 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  27.68 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  20.53 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1345  LytTR family two component transcriptional regulator  21.29 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.25 
 
 		 847 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  29.2 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.67 
 
 		 846 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1723  two component transcriptional regulator, LytTR family  20.79 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5133  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.47 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>