108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1929 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  100 
 
 		 320 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  83.75 
 
 		 321 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  57.83 
 
 		 330 aa  345  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  52.4 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  51.79 
 
 		 339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  50.58 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  38.94 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  38.53 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  38.53 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  38.24 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  38.53 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  38.53 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  38.58 
 
 		 540 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  37.65 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  39.01 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  33.58 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  33.08 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  32.5 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  34.19 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  34.19 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  34.19 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  34.19 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  34.19 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  34.19 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  33.76 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  29.01 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  29.46 
 
 		 383 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  31.79 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  29.75 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  29.46 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  24.66 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.23 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  26.62 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.7 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  30.04 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  26.67 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  27.05 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.76 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  25.83 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  28.81 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  26.81 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  34.21 
 
 		 113 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  26.18 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  25.67 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  33.98 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  33.98 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.69 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  25.64 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  25.08 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.52 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  26.34 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  25.51 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  23.67 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  25.61 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  26.34 
 
 		 346 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  25.26 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  25 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0268  Fatty acid desaturase  32.28 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  25.14 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  25.14 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.1 
 
 		 765 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  35.16 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  25.83 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  23.66 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  26.8 
 
 		 495 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  23.97 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  25.35 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  27.75 
 
 		 355 aa  45.8  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02366  putative transmembrane acyl-COA desaturase (fatty acid desaturase) oxidoreductase protein  40.35 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0749638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  24.89 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  32.18 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  23.87 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  29.63 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  25.55 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  33.33 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  35.44 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  28.7 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  24.66 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  27.73 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  24.77 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  24.1 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  28.18 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  29.17 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  24.92 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>