62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4509 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  100 
 
 
489 aa  968    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  63.07 
 
 
486 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  59.74 
 
 
463 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  28.52 
 
 
338 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  30.33 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  26.43 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  27.63 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  31.15 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  31.15 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  31.15 
 
 
333 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  31.15 
 
 
333 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  29.75 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  31.15 
 
 
333 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  30.11 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  31.15 
 
 
333 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  29.92 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  30.04 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.22 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  29.46 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  29.37 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  29.68 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  28.17 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  28.17 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.19 
 
 
313 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  29.26 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  28.17 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  28.17 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27.78 
 
 
328 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  31.54 
 
 
328 aa  64.7  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  28.17 
 
 
540 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  28.44 
 
 
330 aa  63.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  29.11 
 
 
383 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  25.27 
 
 
378 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  21.48 
 
 
336 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.4 
 
 
330 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  27.23 
 
 
314 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2394  fatty acid desaturase  30.43 
 
 
304 aa  53.9  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
318 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  22.99 
 
 
314 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.19 
 
 
359 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  30.24 
 
 
318 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  30.51 
 
 
290 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  26.2 
 
 
317 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.3 
 
 
353 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.61 
 
 
235 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
355 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  32.99 
 
 
349 aa  47  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  26.72 
 
 
345 aa  47  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.98 
 
 
202 aa  47  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  28.86 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  24.7 
 
 
350 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  26.24 
 
 
215 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  29.27 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5238  PAP2 family protein  24.82 
 
 
215 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  24.82 
 
 
215 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4866  PAP2 family protein  24.82 
 
 
215 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  25.53 
 
 
215 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  25.53 
 
 
215 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  23.83 
 
 
371 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.282739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  24.82 
 
 
215 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  24.07 
 
 
380 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  28.76 
 
 
368 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>