65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0674 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  95.56 
 
 		 315 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  32.99 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  33.21 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  31.35 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  35.31 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  33.87 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  33.54 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  33.54 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  33.54 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  33.54 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  33.23 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  34.05 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  33.54 
 
 		 540 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  33.94 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  31.29 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  30.49 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  30.96 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  31.62 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  27.14 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  32.21 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  23.05 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29.75 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  25.82 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  29.34 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  25.82 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  26.04 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  25.94 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  27.55 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  28.23 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.7 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  28.68 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25.19 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  29.97 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  27.48 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  27.35 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.96 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  26.94 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.51 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  26.48 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  25.25 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  26.51 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  26.1 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  25.09 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  25.16 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  26.02 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  25.45 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  28.08 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  24.9 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.06 
 
 		 475 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  24.07 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.5 
 
 		 765 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  23.28 
 
 		 366 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  25 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>