71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1713 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  64.47 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  59.93 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  37.5 
 
 		 330 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  39.04 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  33.21 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  31.72 
 
 		 360 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  31.72 
 
 		 360 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  31.72 
 
 		 360 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  31.37 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  30.74 
 
 		 378 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  32.12 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  29.3 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  31.05 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  32.6 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  29 
 
 		 344 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.96 
 
 		 765 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  30.26 
 
 		 362 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.1 
 
 		 475 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.7 
 
 		 427 aa  86.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  27.39 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  27.3 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  27.24 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  27.2 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  26.85 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  26.25 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  27.82 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  27.01 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  28.23 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  27.16 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  27.16 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  27.16 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  28.3 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  28.51 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.01 
 
 		 540 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  28.8 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  26.21 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  27.95 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  32.2 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  26.57 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.67 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  22.88 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  22.88 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  25.85 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  27.2 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.27 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  24.16 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  26.54 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  24.69 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  23.89 
 
 		 387 aa  45.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  24.56 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  23.83 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  24.83 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  20.49 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  24.3 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  35.9 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  25.1 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.73 
 
 		 360 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.38 
 
 		 361 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 361 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>