65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3886 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  100 
 
 
315 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  95.56 
 
 
315 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  32.65 
 
 
321 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  33.57 
 
 
339 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  36.04 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  31.02 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  33.87 
 
 
329 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  33.54 
 
 
328 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  33.55 
 
 
328 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  33.54 
 
 
328 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  33.54 
 
 
328 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  33.54 
 
 
328 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  33.54 
 
 
540 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  34.84 
 
 
339 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  31.64 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  32.97 
 
 
338 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  31.25 
 
 
311 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  31.32 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  30.09 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  32.58 
 
 
486 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  28 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  24.33 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  30.11 
 
 
489 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  27.02 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  25.31 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  25.31 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  25.31 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  25.31 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  25.31 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  28.79 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  25.31 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  27.92 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  25.41 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  29.05 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  24.55 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  28.47 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  28 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  27.12 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  27.76 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.21 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  29.57 
 
 
383 aa  56.2  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
360 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  26.83 
 
 
360 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2063  Fatty acid desaturase  26.61 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  26.45 
 
 
360 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.05 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  27.24 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  25.44 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
363 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  28.89 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  24.83 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  25.73 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.93 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  35.56 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  28.16 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  25.31 
 
 
475 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  25.94 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  22.59 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.5 
 
 
765 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  28 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  28 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  23.35 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3059  fatty acid desaturase  37.25 
 
 
371 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  normal  0.161917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>