67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0878 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  100 
 
 		 314 aa  626  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  43.61 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  43.46 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  43.09 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  28.29 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  31.67 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  30.45 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  33.06 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  30.12 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  30.83 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  31.37 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  31.37 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  31.37 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  31.37 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  31.37 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  31.37 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  28.91 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  29.55 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  28.91 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  28.91 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  28.91 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  28.91 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  28.91 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  29.87 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  26.83 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  28.31 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  27.68 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  28.94 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  23.99 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  27.73 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  26.83 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  28.76 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  28.24 
 
 		 486 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  28.09 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  26.09 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  27.23 
 
 		 489 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  25.89 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  33.73 
 
 		 113 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  28.7 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  22.86 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 463 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  26.76 
 
 		 383 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  25.46 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  25.81 
 
 		 685 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  24 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  21.68 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.25 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  23.91 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0742  Fatty acid desaturase  25 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0972  beta-carotene ketolase  27.6 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0162897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  22.58 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  22.58 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  23.99 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  28.17 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  22.42 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  24.35 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.88 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  22.07 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  22.42 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  22.83 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  23.62 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  22.83 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>