60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1782 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  100 
 
 		 383 aa  762    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  33.43 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  29.76 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  30.77 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  30.19 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  30.52 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  32.8 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  29.88 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  30.8 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  30.8 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  30.8 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  30.8 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  30.45 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  30.8 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  30.8 
 
 		 333 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  27.33 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  28.62 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  27.49 
 
 		 540 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  27.49 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  27.49 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  27.49 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.59 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  27.49 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  23.84 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  27.49 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  29 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  29.83 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  25.62 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  27.62 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  26.98 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  29.29 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  27.02 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.03 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  26.76 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  28.66 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.54 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  25 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  25.64 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  25.84 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  25.98 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  25 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  24.63 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  33.59 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  23.44 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  26.23 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  26.72 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  25 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  25.54 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.36 
 
 		 349 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  24.71 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  28.71 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  22.48 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  25.17 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  36.47 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  22.08 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  23.34 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0972  beta-carotene ketolase  34.04 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0162897  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  27.99 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  33.02 
 
 		 685 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  21.93 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>