68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1748 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  100 
 
 		 313 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  50.32 
 
 		 314 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  44.23 
 
 		 318 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  43.09 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  29.1 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  27.85 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  27.68 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  29.84 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  27.41 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  27.41 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  27.41 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  27.41 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  27.41 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  27.41 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  27.41 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  29.03 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  31.15 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  31.15 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  31.15 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  31.15 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  31.37 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  30.82 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  29.41 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  27.84 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  30.94 
 
 		 540 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  28.16 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  30.58 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  27.76 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.88 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  26.89 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  29.33 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  28.57 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2818  fatty acid desaturase  25.68 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00236811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1682  hypothetical protein  43.43 
 
 		 119 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.894508  normal  0.497271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  25.55 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4509  fatty acid desaturase  25.19 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2025  hypothetical protein  24.78 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155906  normal  0.225621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  26.15 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6301  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0620  hypothetical protein  37.66 
 
 		 113 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  24.54 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  26.64 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  25.23 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  26.67 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  26.07 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  26.07 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.16 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  25.79 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  26.82 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  26.34 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  25.54 
 
 		 362 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  24.15 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.75 
 
 		 357 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  25.31 
 
 		 349 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  23.59 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  25.35 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3898  fatty acid desaturase  24.41 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.130799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  23.56 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  24.06 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  24.08 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.5 
 
 		 765 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  22.43 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>