58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2363 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  100 
 
 
298 aa  614  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  86.94 
 
 
291 aa  530  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  86.6 
 
 
291 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  75.09 
 
 
291 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  68.77 
 
 
306 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  66.11 
 
 
331 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  65.86 
 
 
293 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1008  fatty acid desaturase  64.29 
 
 
325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0035682  normal  0.0250889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24321  beta carotene hydroxylase  58.05 
 
 
346 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2058  beta-carotene hydroxylase  56.6 
 
 
370 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02591  Beta-carotene hydroxylase  56.7 
 
 
341 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0286  beta-carotene hydroxylase  56.25 
 
 
349 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.886562  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1603  beta-carotene hydroxylase  58.25 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100418  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03151  beta-carotene hydroxylase  58.25 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0238  beta-carotene hydroxylase  61.6 
 
 
266 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02681  Beta-carotene hydroxylase  56.67 
 
 
299 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02571  Beta-carotene hydroxylase  60.25 
 
 
277 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02581  Beta-carotene hydroxylase  60.85 
 
 
241 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.489908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  31.65 
 
 
685 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  28.79 
 
 
371 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  34.39 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  26.18 
 
 
353 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1365  fatty acid desaturase family protein, putative  25.1 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  25.55 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3148  fatty acid desaturase family protein  24.77 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1471  fatty acid desaturase family protein  24.88 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0513  fatty acid desaturase family protein  24.88 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0530  fatty acid desaturase family protein  24.88 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2899  fatty acid desaturase family protein  24.88 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0695  fatty acid desaturase family protein  24.77 
 
 
343 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  22.9 
 
 
343 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  24.59 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7418  fatty acid desaturase  22.97 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0117  fatty acid desaturase family protein  24.3 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  31.58 
 
 
311 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  23.85 
 
 
343 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  25.91 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  23.85 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.45 
 
 
352 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  23.85 
 
 
343 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  24.15 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  23.85 
 
 
343 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  23.85 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  23.85 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  23.46 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  23.38 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  23.46 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6729  Fatty acid desaturase  25.11 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583204  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  23.46 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  22.11 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3476  fatty acid desaturase  23.42 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.978315  normal  0.0818595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  26.52 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  22.05 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  22.55 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  25.74 
 
 
290 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  21.74 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  34.38 
 
 
320 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2828  fatty acid desaturase  24.62 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>