24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5868 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5868  fatty acid desaturase  100 
 
 		 327 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4982  fatty acid desaturase  55.87 
 
 		 343 aa  364  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  49.05 
 
 		 345 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  45.96 
 
 		 387 aa  301  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22677  dihydroderamide delta-4 desaturase  39.48 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404878  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54788  fatty acid desaturase (DSD1)  38.07 
 
 		 371 aa  206  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.282739 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  35.93 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04405  sphingolipid desaturase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06940)  35.61 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2439  beta-carotene hydroxylase  26.86 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209241  normal  0.0566422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  23.03 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  24.6 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46383  predicted protein  30 
 
 		 454 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.372126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1623  fatty acid desaturase  24.72 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1650  fatty acid desaturase  24.72 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1495  Fatty acid desaturase  21.91 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1693  Fatty acid desaturase  25.53 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3888  Fatty acid desaturase  22.73 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2209  fatty acid desaturase  23.97 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  27.56 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2925  fatty acid desaturase  28.3 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.616004  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  23.55 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4517  fatty acid desaturase, putative  42.55 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.61204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5211  fatty acid desaturase  26.52 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>